隨著生物醫學科技日趨發達，為創造新的趨勢，增加國際競爭力，國立陽明大學於2005年底，特別決定將原有的生物資訊研究所，衛生資訊與決策研究所整併為「生物醫學資訊研究所」，並在2007年完成正式的整併。這使我們在跨領域的整合之外，產生了跨層次的整合，由研究分子與細胞層次的生物資訊，連接到組織、器官、個體，甚至族群層次。而衛生資訊方面也因為生物資訊領域的加入，能由分子機制來瞭解疾病。
